Seurat (一) 安装

发布于 2021-09-19  596 次阅读


  • 安装BiocManager:install.packages("BiocManager", repos="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/" )
  • 为BiocManager添加镜像:options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")
  • 安装Seurat:BiocManager::install("Seurat")
  • 安装devtools:BiocManager::install("devtools")
  • 通过devtools在线安装:devtools::install_github("github_user_name/package_name")
  • 通过devtools离线安装:devtools::install_local("path_to_package_file.zip")
  • 查看或设置lib路径:.libPaths("<dirPath>")
  • 离线安装包:install.packages("<filePath>", repos = NULL)
  • 命令行安装离线包:R CMD INSTALL package.tar.gz


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